Um unerwünschte Paarungen mit anderen Bienenrassen zu verhindern, braucht es definierte Schutzzonen rund um die Belegstationen. Seit 2013 gehört das gesamte Melchtal inklusive der Belegstation zur gesetzlich verankerten Schutzzone der Dunklen Biene. Die Reinrassigkeit der Königinnen wird mittels DNA Test geprüft.